작물에 따라 방제법이 달라질 수 있지만 보통 온실가루이의 경우 생육기간이 짧을 뿐만 아니라 산란수가 많으므로 살충제만으로는 방제효가가 높지 않아 밭 주변을 깨끗하게 하여 기주가 될 수 있는 식물을 없애거나 혼재를 피해주시는 것이 좋고 발생 밀도가 높으면 방제 효과가 낮으므로 주기적으로 발생 여부를 관찰하여 발생 초기에 약제를 2-3회 연속 살포하여 방제 해주시는 것이 좋습니다. 또한 살충제에 대한 저항성을 쉽게 획득하므로 한 가지 계통의 약제보다는 계통이 다른 약제를 번갈아 살포하는 것이 효과적이고 천적으로 온실가루이좀벌을 이용해보시는것도 좋습니다.