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토마토 시드름병은 토양으로 병원균이 전염되어 피해를 입는 병으로 방제를 위해서는 이어짓기를 피하고 병 발생이 심한 토양은 5년이상 돌려짓기 해주시는 것이 좋습니다. 석회 시용으로 토양의 산도를 높이고 토양 선충이나 토양 미소동물에 의해 뿌리에 상처가 나지 않도록 해야 합니다. 미숙퇴비는 사용을 하지 마시고 토양 내 염류농도가 높지 않게 조심해주셔야 합니다. 토양을 장시간 담수 하거나 태양열 소독을 하면 병원균의 밀도를 줄일 수 있습니다.

시들음병은 습해 등으로 뿌리에 상처가 발생된 수 발생합니다 돌려짓기 안해도 됩니다 물관리만 잘하면