고추가 시들어가는 증상은 시들음병과 유사합니다. 시들음병의 초기 증상은 아랫잎이 시들며 밑으로 처지고, 잎이 누렇게 변하며 서서히 죽는 것입니다. 병원균에 의해 침입된 곳은 암갈색을 띠고 괴저가 생기며, 진전되면 지제부의 둘레가 썩습니다. 또한, 병든 뿌리나 땅가 줄기는 검게 보이고 껍질이 쉽게 벗겨지는 특징이 있습니다. 시들음병을 예방하기 위해서는 연작을 피하고, 병발생이 심한 토양은 5년 이상 돌려짓기를 해야합니다. 또한, 석회시용으로 토양 산도를 조절하고 토양 선충이나 토양 미소동물에 의한 뿌리 상처를 방지해야합니다. 미숙퇴비 사용을 금지하고, 토양 내 염류 농도가 높지 않도록 주의해야합니다. 토양을 장기간 담수하거나 태양열소독을 하면 병원균의 밀도를 줄일 수 있습니다. 필요시 등록약제를 사용하여 처리할 수도 있습니다.
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