고추탄저병의 증상은 과실에 발생하며 처음에는 수침상으로 약간 움푹 들어간 원형반점으로 나타나고, 진전되면 병반이 원형 내지 부정형의 겹무늬 증상으로 확대됩니다. 병반부위에는 담황색 내지 황갈색의 포자덩어리가 형성되며, 심하게 병든 과실은 비틀어지고 말라버립니다. 성숙과의 병반은 간혹 흑색의 겹무늬 증상을 띄기도 합니다. 고추탄저병을 예방하기 위해서는 건전종자를 파종하고 건전묘를 이식하고, 종자를 소독하여 파종해야 합니다. 또한, 이 병에 잘 걸리지 않는 품종을 선택하여 재배하고, 등록약제를 병 발생 초기부터 살포해야 합니다. 방제 방법으로는 화학적 방제와 생물학적 방제가 있습니다.