토양수분은 어떤지요? 저온 및 토양과습에 따른 수정불량이 원인일것 같네요. 야간온도를 낮게 관리하시더라도 반드시 일출 2시간전에는 15-18도 정도로 맞춰주셔서 오전 광합성에 주력하시면 좋을듯 합니다. 통상 저온으로 관리될경우 토양수분도 과다한 경우가 많으니 확인해보셔요.
공동과 증상을 말씀하시는 것 같네요,, 원인은 일반적으로 크게 두가지 정도로 생각할 수 있는데요 내부 태좌부 발육이 불량하거나 외부 과피가 과잉비대 했을 경우 입니다. 쉽게 이야기해서 토마토 내외부의 생장 균형이 맞지 않는다는 말씀 입니다. 태좌부 발육 불량의 경우 광부족 저온등에 의해 꽃가루가 제대로 생성 되지 않을 때 발생할 수 있으며, 과피가 과잉비대 했을 경우는 말씀하신대로 수분이 과다하거나 근권의 EC가 지나치게 낮을 경우 발생할 수 있습니다. 우선 근권 EC와 함수율을 측정해 보시고, 적정 수준으로 관리될수 있도록 하시는 것이 좋을 것 같습니다. 또한 야간온도도 고온으로 관리되고 있지 않은지 확인해 보십시오.