사진이 없어 정확한 확인은 어렵습니다만 말씀해주신 내용으로 세균성 구멍병이 아닐까 의심 됩니다.
세균성구멍병의 경우 잎, 가지, 과실에 발생 하며 잎과 과실에서 피해가 큰데 잎에서는 처음에는 갈색 또는 회 갈색의 원형병반이 나타나다가 커지고 병반부 조직은 죽어서 두꺼운 떨켜(잎, 꽃, 과일이 줄기에서 떨어질 때 그 자리에 형성되는 분열조직 또는 유조직 세포층) 가 형성 되면서 구멍이 생기는 것이 특징이고 가지는 주로 어린 가지에서 발생 하며 보랏빛의 병반이 나타나며 점차 갈색으로 되고 오목하게 들어 갑니다. 과실에는 갈색의 작은 반점이 생기면서 점차 커지면서 흑갈색으로 변합니다.
이병이 맞다면 방제 방법으로는 전정 할 때 병든 가지를 제거하여 전염원의 밀도를 줄여 주시는게 좋고 싹이 트기전에 석회유황합제를 살포하면 효과적이며 개화 전 석회 보르도액 살포도 초기 발생에 예방 효과가 있습니다. 물빠짐이 잘되게 하고 질소질 비료를 과다하게 사용하는건 자제 해주시는 것이 좋습니다.