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탄저병 방제를 위한 최고의 방법은 예방을 최우선으로 하는 것으로 우선 포장을 자주 확인하면서 탄저병 걸린 고추 과실을 포장에서 제거 하는 것이 좋습니다.

탄저병 병반을 가지고 있는 과실은 병반 한 개에 천 만개 이상의 병원균 포자 생성이 가능하기 때문에 병든 과실을 제거한 뒤에는 바닥에 버리는 것 보다 모아서 태우거나 고추 재배 포장 외부로 제거하는 것이 좋습니다.

또한 탄저병이 발생한 밭은 연작하지 않는 것이 좋습니다.
탄저병 방제 약제는 아래 링크 보시고 적절한 약제 사용을 추천 드립니다.

https://psis.rda.go.kr/psis/agc/res/agchmRegistStusLst.ps?menuId=PS00263

탄저병 농약 살포는 시기와 방법이 중요하며, 병 발생이 되기 전 살포해주어야 방제 효과가 90% 이상으로 나타납니다.
고추 탄저병은 과실에 발생되는 병이므로 약액이 과실에 묻어야 효과가 있기 때문에 과실에 골고루 묻도록 흠뻑 살포해주어야 효과를 높일 수 있다고 합니다.