토마토는 토층과 지하부의 환경에 민감하게 좌우됩니다. 토마토는 강한 생명력과 뿌리의 신장력, 흡비력을 갖고 있어 과욕으로 물과 비료를 잔뜩 주게될 경우 꽃이 피기 어렵고 착과도 어려우며 뿌리도 비료에 타거나 약해질 뿐 아니라 병에 걸리기도 쉬어집니다. 눈에 보이지 않는 지하의 뿌리 환경을 정비하고 지상부의 건전한 생육에 어울리게 비료를 주면 토마토는 스스로 잘자라줄 것 으로 보입니다.
방울토마토의 크기와 과중은 품종에 따라서 차이가 크게 나기 때문에, 품종중에서도 알이 큰 것을 골라서 키우시면 좋습니다. 방울토마토 크기를 키우기 위해서는 곁순이 강하게 자라지 않도록 순지르기를 신경써주시는 것이 중요합니다. 한번에 과도한 잎따주기를 할 경우에는 과실 비대를 나쁘게 하거나 열과 발생이 쉬워지니 주의하시는 것이 좋습니다.