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고추 풋마름병은 토양으로 전염되는 병이라 예방이 중요합니다.
연작을 피하고 작업시에 식물체에 상처가 나지 않도록 주의해주셔야 합니다. 무엇보다 잔뿌리가 상하지 않도록 미숙 가축분과 화학비료의 과용을 피하시고, 질소질 비료를 많이 사용하지 않으시는 것이 좋습니다. 고추를 심기 전에 등록된 토양소독제를 활용해서 토양소독을 해주시는것도 도움이 됩니다.