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고추무름병은 주로 병든 식물체가 땅에 남아있다가 전염원이 되거나, 병원균을 가지고 있는 해충들이 가해하면서 생깁니다. 따라서 벼나 콩과의 작물로 윤작을 하거나 담배나방의 유충을 제거하는 방식을 미리 예방하는것이 좋습니다. 무름병 전용 등록약제는 아직 없습니다.