마늘 뿌리에서 썩어가는 원인은 다양하지만, 무름병이나 흑색썩음균핵병 때문일 수있습니다. 윤작을 하거나 토양소독을 하시는 방법으로 근본적인 해결을 하시거나 재배중이시면 등록약제를 사다가 방제를 하셔야겠습니다. 병이 아니면 뿌리응애나 구근선충의 피해일 수도 있으니 검게 상한 뿌리에서 벌레나 무름이 보이는지 확인해보시지요.
참깨뿌리 썩는 원인도 다양하지만, 말씀하신 증상을 보니 역병 가능성도 있습니다. 역병에 걸리면 땅 가까이에 있는 줄기가 흑갈색으로 변하면서 시들음 증상이 보이고 아래잎부터 마르기 시작합니다. 역병은 물빠짐이 좋지 못한 밭이나 질소질 비료를 많이 주었을때 발생하기도 합니다.